在使用叶绿素含量测定仪时也需要注意以下几个问题：
1.一般来说我们常常利用叶绿素测定仪来测定植物的叶绿素含量，并以此判断植物的氮元素含量，但是在测算的过程中，确定SPAD临界值是十分关键的，而由于同一生长条件下不同品种间SPAD值存在较大差异，因此针对于不同的品种，要建立不同的SPAD临界值，这样以来利用叶绿素测定仪测算的氮元素含量才有可能是准确的。
2.在使用叶绿素测定仪测定的过程中，如果选用的叶位不同，那么可能得到的测定结果也不同，因此为了得到具有代表性的测定结果，首先应该要同意所选的叶位，一般来说，植株的顶部的几片叶片受土壤中的氮元素含量的影响比较的小，所以在使用进行叶绿素测定仪测量的过程中可以选用顶部的那几片叶子。
3.就同一片叶片而言，其不同的位置测得的SPAD值也是不同的，比如说玉米在叶片中部距基部55%的位置测定结果偏差最小，而在40%～60%区域内测定值变异系数比较低。因此在使用叶绿素测定仪测定的过程中，还需要注意测量方位的选择，以避免测定误差。
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